Оценка эффективности алгоритма выявления случаев недавнего инфицирования ВИЧ-1 в Российской Федерации

Цель. Определение количества случаев недавнего инфицирования ВИЧ-1 позволит эффективно и более точно оценивать динамику распространения возбудителя, длительность периода между заражением и постановкой диагноза, а также качество проводимых скрининговых и профилактических программ. Целью данной работы являлась адаптация алгоритма выявления случаев недавнего инфицирования ВИЧ-1 на когорте пациентов, для которых известна длительность инфекции. Материалы и методы. В исследовании были использованы образцы плазмы крови от 264 ВИЧ-инфицированных пациентов с известной датой инфицирования. Все образцы были проанализированы с помощью двух серологических тест-систем, направленных на дифференцировку случаев недавней и длительно текущей ВИЧ-инфекции. По результатам секвенирования фрагмента региона pol ВИЧ-1 был проведен подсчет доли вариабельных позиций с целью определения длительности инфекции. Для выявления случаев недавнего инфицирования ВИЧ-1 была проведена оценка различных вариантов алгоритма, представляющих собой комбинацию серологических тестов, молекулярногенетического анализа генома вируса и других клинико-лабораторных показателей. Результаты. Эффективность выявления образцов с недавней инфекцией с помощью отечественной тест-системы ДС-ИФА-ВИЧ-АТ-СРОК (ДС) была выше, чем с помощью зарубежной тест-системы Architect HIV Ag/Ab Combo (Abbott): показатели чувствительности и специфичности составили 94,4 и 96,7% для ДС и 86,4 и 77,4% для Abbott соответственно. Порог вариабельности генома ВИЧ-1 в 0,33% позволил дифференцировать исследуемые образцы на две группы с временной отсечкой в 12 мес.: 82,1% ранних образцов и 62,7% поздних образцов были правильно идентифицированы с помощью данного метода. Был проведен анализ эффективности применения различных схем алгоритма, позволяющих выявлять недавнюю инфекцию продолжительностью до 9 мес. после заражения. Заключение. Полученные результаты позволяют рекомендовать использование алгоритма на основе отечественной тест-системы ДС в клинической практике для выявления случаев недавнего инфицирования ВИЧ-1 с целью корректировки показателя заболеваемости и выявления истинно новых случаев инфицирования.

Objective. Accurate identification of recent HIV-1 infection cases will ensure a more effective and precise assessment of the dynamics of virus transmission, the time between infection and diagnosis, and the quality of screening and prevention programs. This study was undertaken to adjust the recent HIV-1 infection testing algorithm using a cohort of patients, in whom the time since infection was known. Materials and methods. We used blood plasma samples obtained from 264 HIV-infected patients with a known date of infection. All samples were analyzed using two serological assays aimed to differentiate between cases of recent and established HIV infection. Using the results of sequencing of the pol region, we calculated the proportion of variable positions in order to determine the duration of infection. To identify the cases of recent HIV infection, we evaluated different variants of a diagnostic algorithm that included a combination of serological tests, molecular genetic analysis of the viral genome, and other clinical and laboratory parameters. Results. The effectiveness of the DS-ELISA-HIV-AB-TERM (DS) assay for the detection of recent infection was higher than that of the Architect HIV Ag/Ab Combo assay (Abbott). The sensitivity and specificity of the DS assay were 94.4% and 96.7%, respectively. The sensitivity and specificity of the Abbott assay were 86.4% and 77,4%, respectively. The HIV-1 genome variability threshold of 0.33% allowed the differentiation between samples depending on the time since infection with a cut-off of 12 months: 82.1% of recent samples and 62.7% of established samples were correctly identified using this method. We analyzed the effectiveness of schemes of the algorithm for the detection of recent infection lasting no longer than 9 months. Conclusion. Our findings allow us to recommend the algorithm based on the Russian DS assay for the detection of recent HIV-1 cases in routine clinical practice. This algorithm will enable the detection of new HIV cases, thereby improving the disease control.

Авторы
Шлыкова А.В.1 , Киреев Д.Е. 1 , Лаповок И.А.1 , Салеева Д.В.1, 2 , Покровская А.В. 1, 3 , Шемшура А.Б.4 , Лебедев П.В.4 , Хотелева Л.В.4 , Стребкова Е.А.5 , Хуртин Д.Г.6 , Спирин А.В.7 , Агафонова О.В.7 , Кириченко А.А.1 , Лопатухин А.Э. 1 , Покровский В.В. 1
Журнал
Издательство
Dynasty Publishing House
Номер выпуска
2
Язык
Русский
Страницы
37-51
Статус
Опубликовано
Том
19
Год
2021
Организации
  • 1 Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
  • 2 Федеральный медицинский биофизический центр им. А.И.Бурназяна ФМБА России
  • 3 Российский университет дружбы народов
  • 4 Клинический центр профилактики и борьбы со СПИД Министерства здравоохранения Краснодарского края
  • 5 Самарская областная клиническая больница им. В.Д.Середавина
  • 6 Самарский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями
  • 7 Министерство здравоохранения Астраханской области
Ключевые слова
Hiv-1; HIV infection; genetic variability; time since infection; duration of infection; Recent infection; Early infection; seroconversion; ВИЧ-1; ВИЧ-инфекция; генетическая вариабельность; давность заражения; длительность инфекции; недавняя инфекция; ранняя инфекция; сероконверсия
Дата создания
16.12.2021
Дата изменения
16.12.2021
Постоянная ссылка
https://repository.rudn.ru/ru/records/article/record/80177/
Поделиться

Другие записи

Колобухина Л.В., Бургасова О.А., Краева Л.А., Гущин В.А., Бурцева Е.И., Кружкова И.С., Хлопова И.Н., Меркулова Л.Н., Краснослободцев К.Г., Кузнецова Н.А., Шидловская Е.В., Дворкина Д.А., Тетова В.Б., Бакалина В.В., Одноралов М.А., Генералова Л.В., Хайруллина А.Р., Антипят Н.А., Шагаев А.В., Амброси О.Е., Келли Е.И., Ушакова Е.Е., Сметанина С.В.
Infektsionnye Bolezni. Dynasty Publishing House. Том 19. 2021. С. 5-15