Изобретение относится к химико-фармацевтической промышленности и касается капсул с порошковой фармацевтической ингаляционной композицией для лечения аутоиммунных заболеваний. Наполнитель для капсульного ингалятора содержит тимодепрессин в виде тонкодисперсных частиц респирабельных размеров в количестве 8,5–11,5 мас.% и инертный носитель – ингаляционную лактозу - остальное. Использование изобретения обеспечивает расширение арсенала лекарственных средств для ингаляционного введения при лечении аутоиммунных заболеваний, обеспечивающих доставку препарата в кровь в неизмененном виде. 3 ил., 3 пр.