Исследования проб из биоценозов Арктики и Антарктики за 10 лет установило увеличение пейзажа выделяемых бактерий: на архипелаге Шпицберген в 2010-2011 гг. – 25 видов бактерий, в 2018-2019 гг. – 58; в Антарктиде в 2011 г. – 46, в 2019 г. – 55. Благодаря этим работам создан музей из 587 полярных штаммов. Значительные различия природно-климатических условий способствуют превалированию микроорганизмов, принадлежащих к разным таксонам – в естественных биоценозах Арктического региона чаще встречаются семейства Moraxellaceae и Pseudomonadaceae, а в Антарктиде – Yersiniaceae и Neisseriaceae. По генетическим и фенотипическим маркерам вирулентности у Serratia spp показана высокая адгезивная активность и способность к биопленкообразованию. Обнаружены резистентные к антибактериальным препаратам фенотипы бактерий: Stenotrophomonas, Acinetobacter, Pseudomonas. Для оценки антропогенного и орнитогенного загрязнения окружающей среды на территории Антарктиды и динамичного слежения за её состоянием предложен биологический индикатор – цианобактериальные маты. Наличие Y. intermedia во всех видах биоценозов указывает на вероятность инфицирования жителей, находящихся в условиях холодового стресса. Ретроспективный анализ результатов выделения иерсиний показал закономерность: с 90-х годов XX века в объектах окружающей среды Ленинградского гарнизона отмечается смена этиологически значимых возбудителей иерсиниозной инфекции: вместо Y. pseudotuberculosis преобладают: Y. enterocolitica, Y. kristensenii, Y. intermedia, Y. mollaretii, что связано с социально-экономическими причинами. Результаты проведенных скрининговых и детальных исследований предложено вносить в электронные таблицы, сопряженные с базами многоуровневых геоинформационных систем для оперативного анализа и прогнозирования ситуации по распространенности микроорганизмов в высоких широтах. Данные исследования позволяют предложить алгоритм надежного и объективного микробиологического мониторинга сапрозоонозов в экстремальных условиях полярных регионов Земли.