Идентификация Drosophila melanogaster методом полимеразной цепной реакции

D. melanogaster - одна из наиболее вредоносных плодовых мух, повреждающих цитрусовые и многие другие сельскохозяйственные растения. Молекулярный метод диагностики был создан для идентификации D. melanogaster от другого некарантинного вида Drosophila spp. Предложенный метод дифференциации заключается в использовании фрагмента гена цитохромоксидазы субъединицы 1 митохондриальной ДНК размером 709 п. н. С помощью праймеров Droso-S391 и Droso-A381 были амплифицированы образцы ДНК D. melanogaster, D. suzukii и D. Simulans в лабораторных образцах из разных стран, далее их сравнили с последовательностями других таксонов Drosophila из базы GenBank. Результаты проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) на основе полиморфизма нуклеотидных последовательностей показали, что данные праймеры точно идентифицируют участок гена, также как и специфические праймеры Drosophila melanogaster.

Specific Identification Method based on PCR for Drosophila melanogaster

D. melanogaster is one of the most harmful citrus fruit flies having a large number of host plants. The molecular diagnostic method has been created for identification the D. melanogaster from another non-quarantine species Drosophila spp. The proposed method for differentiation is to use the mitochondrial DNA cytochrome oxidase I gene region 709-bp. We amplified samples of DNA with primers Droso-S391 and Droso-A381 by D. melanogaster, D. suzukii, and D. Simulans collections in the laboratory samples from many countries and contrasted with sequences of other GenBank Drosophila taxa. The findings of a polymerase chain reaction (PCR) based on DNA sequence polymorphisms showed that these primers accurately identify the area of the gene as well as the unique primers of Drosophila melanogaster.

Авторы
Naserzadeh Yousef 1, 2 , Pakina E.N. 1 , Nafchi A.M.3 , Gadzhikurbanov A.S. 1
Издательство
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Российский университет дружбы народов (РУДН)
Номер выпуска
2
Язык
Английский
Страницы
134-141
Статус
Опубликовано
Том
15
Год
2020
Организации
  • 1 Peoples’ Friendship University of Russia
  • 2 All-Russian Plant Quarantine Centre
  • 3 University Sains Malaysia
Ключевые слова
идентификация; диагностика; полимеразная цепная реакция; пцр; карантин растений; identification; diagnosis; drosophila melanogaster; pcr; plant quarantine
Дата создания
02.11.2020
Дата изменения
19.11.2020
Постоянная ссылка
https://repository.rudn.ru/ru/records/article/record/68241/