Выделение и анализ областей интереса врача-исследователя по данным МРТ головного мозга лабораторных животных

Работа посвящена разработке методов автоматического выделения и анализа областей интереса врачей-исследователей, занимающихся изучением влияния трансплантированных мезенхимальных стволовых клеток на очаги ишемического инсульта у лабораторных животных. Области интереса представлены зонами ишемического поражения на T2-снимках МРТ и скоплениями стволовых клеток на SWI-снимках МРТ. Для сегментации зон ишемии рассматриваются возможности выделения спектральных и визуальных информативных характеристик с применением преобразования Фурье. Формализация задачи трекинга скоплений стволовых клеток сведена к транспортной задаче. Наиболее вероятное движение скоплений визуализируется с помощью средств когнитивной графики, что помогает врачам-исследователям строить стратегии возможного лечения с применением клеточной терапии.

The work is devoted to the development of methods for the automatic isolation and analysis of areas of interest for physician-researchers studying the effect of transplanted mesenchymal stem cells on foci of ischemic stroke in laboratory animals. Areas of interest are represented by ischemic areas on T2 MRI-scans and stem cell clusters on SWI MRI-scans. For segmentation of ischemic zones, the possibilities of identifying spectral and visual informative characteristics using the Fourier transform are considered. The formalization of the task of tracking stem cell clusters is reduced to a transportation problem. The most likely movement of the clusters is visualized using cognitive graphics, which helps the physician-researcher to formulate strategies for possible treatment using cell therapy.