КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ ТРАНСКРИПЦИИ У РАСТЕНИЙ И РЕКОНСТРУКЦИЯ РЕГУЛЯТОРНЫХ ГЕННЫХ СЕТЕЙ НА ОСНОВЕ ДАННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ СЕКВЕНИРОВАНИЯ

Проблема исследования устойчивости растений к внешнему стрессу требует применения междисциплинарных методов, основанных на биоинформационных подходах, анализе данных секвенирования, что в свою очередь предполагает разработку специализированных компьютерных инструментов. Рассмотрены несколько направлений применения методов биоинформатики, моделирования генных сетей растений, на основе данных высокопроизводительного геномного секвенирования, для исследования структуры генома модельных растений с точки зрения ответа на стрессовые воздействия окружающей среды, для решения агробиотехнологических задач. Проведено исследование кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов в геномах ряда модельных растений. Предложена гипотеза об общем характере распределения кластеров сайтов связывания в геноме по числу различных транскрипционных факторов, обусловленном свойствами регуляторной генной сети. Задачи исследования структуры генома растений развиваются на примере нескольких моделей сельскохозяйственных культур.

Conference proceedings
Publisher
Российский университет дружбы народов (РУДН)
Language
Russian
Pages
141-144
Status
Published
Year
2022
Organizations
  • 1 Российский университет дружбы народов
Keywords
биоинформатика; агробиология; ответ растений на стресс; генные сети; регуляция экспрессии генов; анализ данных секвенирования
Date of creation
28.12.2023
Date of change
28.12.2023
Short link
https://repository.rudn.ru/en/records/article/record/98389/
Share

Other records