ИССЛЕДОВАНИЕ ТАКСОНОМИЧЕСКОГО СОСТАВА КУЛЬТИВИРУЕМЫХ ГРУПП МИКРООРГАНИЗМОВ КИШЕЧНОЙ МИКРОБИОТЫ У ДЕТЕЙ, СТРАДАЮЩИХ АТОПИЧЕСКИМ ДЕРМАТИТОМ

Состав кишечной микробиоты (КМ) определяли путем высева серийных разведений испражнений на чашки Петри с питательными средами. Выделение анаэробов проводили на Schaedler Agar, Anaerobe Basal Agar, Columbia Agar, Iron Sulphite Agar и Perfringens Agar Base. Лактобациллы выделяли на Lactobacillus MRS Agar. Аэробные бактерии выделяли на Endo Agar, Gelatin Mannitol Salt Agar, m-Enterococcus Agar и Columbia Agar. Грибы выделяли на Sabouraud Chloramphenicol 2 Agar. Идентификацию микроорганизмов проводили методом MALDI TOF MS (Vitek MS Plus (bioMerieux)) и секвенированием гена 16S рРНК, с последующим анализом в базе данных GenBank. Состав микроорганизмов КМ изучен у 6 детей обоего пола возрастом от 3 до 8 лет, с диагнозом АД, наблюдавшихся в РДКБ г. Москвы. Индекс тяжести АД (SCORAD) варьировал от 31 до 83 баллов (средне 55±18). От 6 детей было выделено 622 штамма микроорганизмов. Было выявлено, что бактерии принадлежат к 4 типам, 10 классам, 14 порядкам, 24 семействам, 51 роду и 83 видам домена бактерий. От одного ребенка был выделен 1 вид грибов, относящихся к роду Aspergillus. Грибы рода Candida обнаружены не были. Общее количество бактерий на один грамм фекалий составило 11,0±0,2 log10 КОЕ/г. Доминирующими по количеству и частоте встречаемости были бактерии типов Bacteroidetes (10,7±0,2 log10 КОЕ/г), Actinobacteria (10,2±0,5 log10 КОЕ/г), Firmicutes (10,1±0,5 log10 КОЕ/г) и Proteobacteria (9,2±0,3 log10 КОЕ/г). Вывод. Использованный подход позволил выделить доминирующие, в том числе, трудно-культивируемые группы бактерий, изучение параметров колонизации кишечника которыми поможет в установлении патогенетических механизмов влияния микробиоты на аллергический статус детей с АД.