Молекулярная идентификация нематоды Ditylenchus destructor методом полимеразной цепной реакции с использованием специфических праймеров в Московской области

Картофель Solanum tuberosum L. - одна из наиболее важных продовольственных и технических культур, а Ditylenchus destructor является патогенной нематодой картофеля и числится в качестве карантинного вредного организма во многих странах и регионах. Поэтому был оптимизирован протокол полимеразной цепной реакции (ПЦР), который надежно и быстро идентифицирует деструктор Ditylenchus. Видоспецифичный внутренний транскрибируемый спейсер (ITS) использовали в качестве праймера гена рибосомальной ДНК деструктора Ditylenchus. Некоторые популяции этого вида в Московской области были исследованы с помощью видоспецифического праймера ПЦР. Новая последовательность из ITS-рРНК была депонирована в GenBank под инвентарным номером MN122076. Современная молекулярная техника лучше подходит для различения видов нематод, поскольку она практична, быстра и точна.

Molecular identification of Ditylenchus destructor nematode with PCR Species-Specific primers in the Moscow region

Potato ( Solanum tuberosum L.) is one of the most vital food and industrial crop and Ditylenchus destructor is an influential pathogenic potato nematode and is quarantine pest in many states and territories. As a result, the polymerase chain reaction (PCR) protocol was optimized to identify Ditylenchus destructor reliably and rapidly. The species-specific internal transcribed spacer (ITS) was used as the primer of the D. destructor ribosomal DNA gene. Some populations of this species from the Moscow region in the Russian Federation were investigated through species-specific primer PCR. New sequence from ITS-rRNA was deposited in the GenBank under accession number MN122076. The current molecular technique is more appropriate to distinguishing of nematode species, since it is practical, fast and precise.

Authors
Mahmoudi Niloufar 1, 3 , Naserzadeh Yousef 1, 3 , Pakina E.N. 1 , Limantceva L.A.3 , Nejad D.K.2
Publisher
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Российский университет дружбы народов (РУДН)
Number of issue
4
Language
English
Pages
430-436
Status
Published
Volume
14
Year
2019
Organizations
  • 1 Peoples’ Friendship University of Russia (RUDN University)
  • 2 Russian Plant Quarantine Center (VNIIKR)
  • 3 Semnan University
Keywords
картофель; диагностика; видоспецифический праймер; полимеразная цепная реакция; нематода; внутренний транскрибируемый спейсер; potato; diagnosis; Ditylenchus destructor; PCR Species-Specific; nematode; Its
Date of creation
20.02.2020
Date of change
19.11.2020
Short link
https://repository.rudn.ru/en/records/article/record/60487/
Share

Other records

Chamurliev O.G., Sidorov A.N., Kholod A.A., Chamurliev G.O., Bogomolova N.V.
RUDN Journal of Agronomy and Animal Industries. Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Российский университет дружбы народов (РУДН). Vol. 14. 2019. P. 347-361
Meznikova M.V., Borisenko I.B., Ulybina E.I., Boyarkina O.V.
RUDN Journal of Agronomy and Animal Industries. Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Российский университет дружбы народов (РУДН). Vol. 14. 2019. P. 453-465