Изобретение относится к медицине, а именно к стоматологии, и может быть использовано для исследования верхних дыхательных путей. Ставят предварительный диагноз. Проводят конусно-лучевую компьютерную томографию (КЛКТ) черепа. Получают цветовую визуализацию верхних дыхательных путей при помощи программы Diagnocat. Определяют значения общего объема дыхательных путей, значение верхнего (UPW), среднего (MPW) и нижнего (LPW) фарингеального пространства, значение наибольшего сужения дыхательных путей в сагиттальной плоскости (PASmin) и уровень расположения максимального сужения. Определяют значение аденоидного индекса (A/N) и его отклонение от нормы с определением степени увеличения аденоидов и степени обструкции носоглотки. По результатам КЛКТ уточняют предварительный диагноз. Направляют пациента к смежным специалистам по показаниям для оказания комплексной медицинской помощи, а также ставят окончательный диагноз и комплексно оценивают морфофункциональное состояние верхних дыхательных путей. Способ обеспечивает оптимизацию планирования лечения пациентов с зубочелюстными аномалиями и сопутствующей патологией верхних дыхательных путей за счет заявленных диагностических показателей. 3 ил., 1 пр.