Способ относится к области ветеринарной медицины, и может быть использован для стабилизации позвоночного столба. Данный способ позволяет повысить прочность костной структуры, фиксирующей первый шейный позвонок относительно второго шейного позвонка. Способ хирургического лечения атлантоаксиальной нестабильности у карликовых пород собак заключается в том, что получают аутотрансплантант из губчатой ткани крыла подвздошной кости. Далее выполняют дорсальный доступ к дорсальной дужке первого шейного позвонка и остистому отростку второго шейного позвонка. Полученный аутотрансплантант имплантируют на дорсальную дужку первого шейного позвонка, фиксируют его тремя проволочными серкляжами, скелетируют краниальную часть второго шейного позвонка. В остистом отростке второго шейного позвонка формируют три отверстия, репонируют первый и второй шейный позвонки между собой. При этом производят фиксацию первого и второго шейных позвонков концами проволочных швов, которые фиксируют первый аутотрансплантант и дорсальную дужку атланта между собой, путем проведения их через отверстия, сформированные в остистом отростке эпистрофея. Второй аутотрансплантант формируют из губчатой ткани крыла подвздошной кости, противоположного крылу ранее полученного трансплантата, и помещают его в виде мостика между первым и вторым шейными позвонками.