КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ ТРАНСКРИПЦИИ У РАСТЕНИЙ И РЕКОНСТРУКЦИЯ РЕГУЛЯТОРНЫХ ГЕННЫХ СЕТЕЙ НА ОСНОВЕ ДАННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ СЕКВЕНИРОВАНИЯ

Проблема исследования устойчивости растений к внешнему стрессу требует применения междисциплинарных методов, основанных на биоинформационных подходах, анализе данных секвенирования, что в свою очередь предполагает разработку специализированных компьютерных инструментов. Рассмотрены несколько направлений применения методов биоинформатики, моделирования генных сетей растений, на основе данных высокопроизводительного геномного секвенирования, для исследования структуры генома модельных растений с точки зрения ответа на стрессовые воздействия окружающей среды, для решения агробиотехнологических задач. Проведено исследование кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов в геномах ряда модельных растений. Предложена гипотеза об общем характере распределения кластеров сайтов связывания в геноме по числу различных транскрипционных факторов, обусловленном свойствами регуляторной генной сети. Задачи исследования структуры генома растений развиваются на примере нескольких моделей сельскохозяйственных культур.