С осадочным веществом озерного происхождения и его ролью в континентальном литогенезе связано образование широкого спектра полезных ископаемых, некоторые из которых практически не формируется в иных фациальных обстановках. Запасы лимногенных полезных ископаемых имеют важное ресурсное значение. Они содержат, кроме месторождений строительного сырья (пески, глины, известняки), эвапориты (трона, тенардит, гипс, эпсонит, галит, карналлит, сильвин, бишофит и др.), угли, горючие сланцы, цеолиты, бораты, служат источниками и резервуарами различных углеводородов, в том числе нефти и газа. Наряду с неметаллическими полезными ископаемыми в озерных структурах накапливаются железомарганцевые, медные руды и бокситы и некоторые другие рассеянные рудные компоненты, связанные, например, с горючими сланцами и эвапоритами.