Вклад консенсусной 5’-нетранслируемой области в эффективность трансляции гетерологичных генов в растительных клетках

Результаты биоинформатического анализа позволили выявить следующую закономерность: средний размер 5’-нетранслируемой области (5'-НТО) для большинства генов A. thaliana с высоким уровнем экспрессии варьирует от 80 до 120 п. н. со средним содержанием GC 36,5%. На основании результатов выравнивания определена консенсусная 5'-НТО как новый регуляторный элемент, который потенциально может обеспечить высокоэффективную экспрессию и синтез целевого продукта в растениях. Эта последовательность имеет размер 87 п.н. и GC содержание 35,6%. Продемонстрировано, что консенсусная 5'-НТО обеспечивает увеличение накопления бирепортерного белка более, чем на 25%, тем самым выступает в качестве потенциального позитивного регуляторного элемента в эффективности трансляции.

Contribution of consensus 5'-untranslated region to the translational efficiency of heterologous genes in plant cells

The results of bioinformatics analysis allowed to reveal the following consistent pattern: the average length of the 5'-untranslated region (5'-UTRs) for most A. thaliana's genes with high expression levels range from 80 to 120 bp, with an average GC content of 36,5%. Based on alignment results was defined motive in 5'-UTRs, as a new regulatory element, which could potentially provide highly efficient expression and synthesis of the target product in plants. This sequence has a length of 87 bp and GC content of 35.6%. It was demonstrated that consensus sequence of 5'-UTRs increased accumulation of the bi-reporter protein more than 25%, by that acting as a potential positive regulatory element on translational efficiency.

Авторы
Кимиссе М.Г.1 , Кабардаева К.В.2 , Гра О.А.3 , Тюрин А.А.3
Издательство
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Российский университет дружбы народов (РУДН)
Номер выпуска
3
Язык
Русский
Страницы
56-68
Статус
Опубликовано
Год
2015
Организации
  • 1 Российский университет дружбы народов
  • 2 РГАУ - МСХА имени К.А. Тимирязева
  • 3 Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН
Ключевые слова
РАСТЕНИЯ; PLANTS; 5'-НЕТРАНСЛИРУЕМАЯ ОБЛАСТЬ; 5''-UNTRANSLATED REGION; ТРАНСЛЯЦИЯ; TRANSLATION; ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ; GENE EXPRESSION
Цитировать
Поделиться

Другие записи

Petrov A.K., Gnezdilova L.A.
Вестник Российского университета дружбы народов. Серия: Агрономия и животноводство. Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Российский университет дружбы народов (РУДН). 2015. С. 95-100