Усовершенствование методов диагностики возбудителя бактериального ожога риса на основе ПЦР

На основе анализа оригинальных и ранее опубликованных последовательностей ДНК Xanthomonas oryzae pv. oryzae были разработаны праймеры для ПЦР «в реальном времени», позволяющие достоверно идентифицировать возбудителя бактериального ожога риса, без перекрестных реакций с близкородственными видами. Была оптимизирована среда для БИО-ПЦР YPGA, содержащая в качестве селектирующих факторов антибиотики циклогексимид 50 мг/л + цефазолин 30 мг/л + гентамицин 2 мг/л. Показано, что чувствительность праймеров при БИО-ПЦР с использованием оригинальной селективной питательной среды в 100 раз эффективнее прямого ПЦР анализа. Оптимизированная БИО-ПЦР диагностика возбудителя бактериального ожога риса позволяла обнаружить 50 КОЕ/мл семенного экстракта.

Development diagnostic methods of bacterial blight of rice on based PCR

Primers identifying bacterial blight pathogen, without cross-reactions with closely related species were designed based on the analysis of the original and GeneBank DNA sequences of Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Media YPGA containing cycloheximide 50 mg / l + cefazolin 30 mg / l + gentamicin 2 mg / l has been optimized for BIO-PCR. Sensitivity of the BIO-PCR analysis using original selective media up to 100 times more effective than direct PCR analysis. The sensitivity of the primers in BIO-PCR analysis with original selective media has achieved 50 CFU/ml.