В настоящей статье представлены результаты анализа работы системы арбитражных судов в Российской Федерации. Исследованы вопросы деятельности государственных арбитражных судов, а также третейских судов и международных коммерческих арбитражей. Отражены мероприятия, направленные на обеспечение открытости и доступности правосудия. Проанализирован вопрос создания в системе арбитражных судов Суда по интеллектуальным правам. Представлена актуальная организационно-правовая проблематика в деятельности системы арбитражных судов и возможные пути их решения (в том числе с учетом концепции целевой программы развитие судебной системы России на 2013-2020 годы), включая строительство зданий и сооружений. Представлено мнение об отсутствии понятия арбитражных судов в Конституции Российской Федерации и вопросы отсутствия полноценного специального статуса у Третейских Судей.