Разнообразие штаммов возбудителя бактериального ожога сои Pseudomonas savastanoi pv. glycinea в РФ

Бактериальный ожог, вызываемый бактерией Pseudomonas savastanoi pv. glycinea (Psg), является одной из самых вредоносных бактериальных болезней сои. Болезнь способна снижать урожайность (до 40 %), масличность и всхожесть семян. Меры защиты и снижения вредоносности патогена должны носить комплексный характер, наиболее кардинальной из них является селекция на устойчивость. Для выведения устойчивых сортов необходима оценка разнообразия патогена на территории районирования будущего сорта и селекция в отношении наиболее распространенных и вредоносных форм патогена. Цель исследования — характеристика циркулирующих на территории РФ штаммов Psg как возбудителей бактериального ожога сои. Из растений и семян сои, выращенных в разных регионах РФ, выделили 12 штаммов возбудителя бактериального ожога сои Psg. Выделенные штаммы были идентичны референтному штамму Psg CFBP 2214 по флуоресценции, морфологии колоний на среде Кинга Б и результатам теста LOPAT (+, –, –, –, +) и образовывали ампликон при видоспецифичном ПЦР-анализе гена cfl (коронафакат-лигазы). Штаммы обладали разной степенью вирулентности при инокуляции растений сои сорта Касатка, и значения ширины зоны с симптомами при искусственной инокуляции листьев варьировали от 3,23 мм (у штамма G7) до 6,53 мм (у штамма G4). Последовательности генов gltA и ITS 16S-23S рРНК российских штаммов имели низкую степень генетического полиморфизма и высокую (95,8…98,8 %) идентичность с соответствующими последовательностями штаммов возбудителя бактериального ожога сои из базы данных NCBI. Анализ расового состава штаммов показал, что доминирующей в стране является раса 4.

Diversity of soybean bacterial blight pathogen Pseudomonas savastanoi pv. glycinea in the Russian Federation

One of the most harmful bacterial diseases of soybean is bacterial blight caused by bacterium Pseudomonas savastanoi pv. glycinea. The pathogen can reduce soybean yield (up to 40 %), oil content and seed germination. To manage the pathogen damage, protection measures should be comprehensive, the most cardinal of which is breeding for resistance. To obtain resistant varieties, it is necessary to understand the diversity of the pathogen in the area and to breed against the most common and harmful forms of the pathogen. In this regard, the aim of the study was to characterize Pseudomonas savastanoi pv. glycinea strains circulating in the Russian Federation as casual agents of bacterial blight of soybean. 12 strains of the soybean bacterial blight pathogen were isolated from soybean plant parts and seeds grown in different regions of the Russian Federation. The isolated strains were identical to the reference strain Psg CFBP 2214 in fluorescence, colony morphology on King B medium and LOPAT test results (+, , , , , +) and formed an amplicon in specific PCR analysis of cfl (coronafacate ligase) gene. The strains had different virulence to Kasatka soybean plants, and the width of symptomatic zone when leaves were artificially inoculated ranged from 3.23 mm (in strain G7) to 6.53 mm in strain G4. Comparison of the obtained gltA and ITS 16S-23S rRNA gene sequences showed a high (95.898.8 %) identity to the bacterial blight pathogen strains deposited to NCBI Genbank, and phylogenetic analysis showed a low intra-strain genetic polymorphism. Analysis of the race composition of the strains showed that the race 4 was predominant in the Russian Federation.