Проведен анализ работы российского программного продукта проверки на наличие плагиата системы «Антиплагиат». Исследование проводили на более 200 магистерских диссертациях, 14 кандидатских и 3 докторских диссертациях, защищенных в Российской академии народного хозяйства и государственной службы при Президенте РФ и в Российском университете дружбы народов. При проведении анализа использовался российский программный продукт - система «Антиплагиат». Исследованы особенности и недостатки системы «Антиплагиат», искажающие оценку оригинальности текста в автоматическом режиме. Отмечено, что названия организаций, министерств, ведомств и т.д. воспринимаются системой как плагиат, поэтому проверяющий обязан в ручном режиме сделать соответствующую правку. Кроме того, самоцитирование, названия законов, постановлений правительства, указов Президента РФ, не зависимо от того, есть ли на них ссылка, воспринимаются системой как плагиат, поэтому проверяющий обязан в ручном режиме сделать соответствующую правку. Подчеркивается, что к разработке системы «Антиплагиат» необходимо привлечь специалистов по структурной лингвистики, которые смогут существенно помочь в исправлении недостатков этой системы.