Изобретение относится к медицине, а именно к урологии, и может быть для выявления хронического уретрита у мужчин. В клиническом материале – мазке из уретры - с помощью газовой хроматографии масс-спектрометрии идентифицируют и количественно оценивают молекулярные компоненты микробного происхождения. И при повышении уровня не менее 3 условно-патогенных микроорганизмов, в соответствии с таблицей 3, представленной в описании, при повышении суммарного уровня этих показателей как минимум на 50% выше здоровой группы, диагностирую хронический уретрит, обусловленный условно-патогенными микроорганизмами. Способ позволяет повысить точность диагностики хронического уретрита за счет оценки совокупности наиболее значимых показателей. 3 з.п. ф-лы, 14 ил., 3 пр.