Проведенные в диссертации теоретические исследования и разработанный на основе этих исследований алгоритмически-программный комплекс позволяет включить результаты модели квантовых измерений в экспериментальные исследования атомно-молекулярных структур. Методы моделирования непрерывного и дискретного спектра квантовых наблюдаемых обобщены с класса дифференциальных операторов на класс псевдо-дифференциальных операторов. Развиты качественные и количественные методы исследования дискретного спектра псевдо-дифференциальных операторов Гамильтона специального вида с нецентральными потенциалами. Проведена разработка, обоснование и тестирование эффективных числительных аналитических методов исследования спектральных характеристик псевдо-дифференциальных операторов с применением современных компьютерных технологий. Реализованы эффективные численные методы и алгоритмы отыскания дискретного спектра псевдо-дифференциальных измеренных операторов Гамильтона с учетом возрастающей сложности моделей в зависимости от сложности квантового измерительного инструмента в виде комплексов проблемно-ориентированных программ для проведения серии численных экспериментов.