Современные подходы к выявлению и изучению эпигенетически активных ксенобиотиков

Цель исследования - анализ существующих методических подходов к тестированию и изучению эпигенетической активности ксенобиотиков.Материалы и методы. При подготовке обзора были использованы информационные базы биомедицинской литературы SciVerse Scopus (538), PubMed (746), Web of Science (625), РИНЦ (45). Для получения полнотекстовых документов использованы электронные ресурсы PubMed Central (PMC), Research Gate, РИНЦ, КиберЛенинка. В тексте обзора процитированы 87 современных публикаций (2010-2019 гг.), а также 17 статей основоположников анализируемых в обзоре методик, которые используются и в наши дни.Результаты. В обзоре рассмотрены современные данные по основным закономерностям функционирования системы регуляции экспрессии генов на уровне метилирования ДНК и модификации гистонов, описаны модельные организмы, используемые как при тестировании ксенобиотиков на эпигенетическую активность, так и для детального изучения их конкретных эффектов на отдельные механизмы эпигенетической регуляции транскрипции. Поскольку в настоящее время не разработаны тест-системы, позволяющие интегрально оценить эффекты ксенобиотиков на эпигенетическую систему регуляции транскрипции, в обзоре представлены методы оценки выявления влияний различных факторов окружающей среды, в том числе различных ксенобиотиков, на метилирование ДНК и модификацию гистонов.Заключение. Современные представления о механизмах эпигенетической регуляции экспрессии генов, использование существующих модельных систем и модельных организмов, а также применение различных методологических и методических подходов позволяют проводить широкое тестирование ксенобиотиков, в том числе медицинских препаратов и соединений, синтезированных для выполнения народнохозяйственных задач, на эпигенетическую активность. Выявление эпигенетически активных соединений важно в плане совершенствования профилактики и лечения ряда заболеваний и, прежде всего, злокачественных новообразований.

Modern approaches for the screening of epigenetically active xenobiotics

Objective. Review of the modern methodological approaches for testing and studying the epigenetic activity of xenobiotics.Materials and methods. In preparing the review, we used information databases of biomedical literature SciVerse Scopus (538), PubMed (746), Web of Science (625), RSCI (45). To obtain full-text documents, electronic resources of PubMed Central (PMC), Research Gate, RSCI, CyberLeninka were used. In the text of the review, 87 modern publications (2010-2019) were cited, as well as 17 earlier articles published by the founders of the methods, which are used today.Results. In the review, current data on epigenetic regulation for gene expression at the level of DNA methylation and histone modification are discussed, in vitro model systems and model organisms are described, and modern methods for screening of epigenetically active xenobiotics are presented.Conclusion. Modern data concerning the mechanisms of epigenetic regulation of gene expression, the usage of existing model systems and model organisms, as well as the application of various methodological approaches and techniques, allow extensive screening of xenobiotics (including drugs and compounds synthesized for national economic tasks) for epigenetic activity. The identification of epigenetically active compounds is important in terms of improving the prevention and treatment of a number of diseases and, in particular, malignant neoplasms.

Authors
Maksimova V.P.1 , Bugaeva P.E.2 , Zhidkova E.M.1 , Usalka O.G.2 , Lesovaya E.A.1, 3 , Belitsky G.A.1 , Yakubovskaya M.G.1 , Kirsanov K.I. 1, 4
Publisher
Общество с ограниченной ответственностью "Издательский дом "АБВ-пресс"
Number of issue
3
Language
Russian
Pages
8-27
Status
Published
Volume
6
Year
2019
Organizations
  • 1 N.N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology, Ministry of Health of Russia
  • 2 Sechenov First Moscow State Medical University, Ministry of Health of Russia
  • 3 I.P. Pavlov Ryazan State Medical University
  • 4 Peoples’ Friendship University of Russia
Keywords
метилирование ДНК; ацетилирование гистонов; модельные организмы; бисульфитная конверсия; секвенирование; вестерн-блоттинг; рестрикционный анализ; DNA methylation; histone acetylation; model organisms; bisulfite conversion; sequencing; Western blotting; Restriction analysis
Date of creation
20.02.2020
Date of change
20.02.2020
Short link
https://repository.rudn.ru/en/records/article/record/61825/
Share

Other records

Beschastnyi V.A., Gaidamaka Y.V.
Современные информационные технологии и ИТ-образование. Фонд содействия развитию интернет-медиа, ИТ-образования, человеческого потенциала Лига интернет-медиа. Vol. 15. 2019. P. 263-273
Fetisov T.I., Kirsanov K.I., Borunova A.A., Zatsepina M.N., Lesovaya E.A., Zabotina T.N., Belitsky G.A., Yakubovskaya M.G.
Успехи молекулярной онкологии. Общество с ограниченной ответственностью "Издательский дом "АБВ-пресс". Vol. 6. 2019. P. 58-68