Показано, что максимальное генетическое разнообразие на всем ареале атлантического лосося наблюдается в популяциях Кольского полуострова, это связано с историей заселения региона рыбами в послеледниковый период. Уникальные популяции Кольского полуострова находятся в настоящее время в хорошем состоянии. Однако в связи с тем, что в качестве основной меры охраны вида практикуется искусственное поддержание популяций, исследованы генетические процессы, имеющие место в ходе искусственного воспроизводства атлантического лосося: отбор на устойчивость к искусственным условиям выращивания (неконтролируемый отбор), гибридизация с близким видом - кумжей, перемешивание популяций. Показано, что в настоящее время основное влияние на генофонд искусственно поддерживаемых популяций оказывает неконтролируемый отбор.