Важность кишечной микрофлоры для здоровья человека давно доказана многими исследованиями. Кишечные бактерии не только помогают переваривать пищу, но и участвуют в регуляции обмена веществ в целом, активно сотрудничают с иммунной системой, поддерживают организм в борьбе с бактериальными и вирусными инфекциями. В разных отделах желудочно-кишечного тракта человека обитает от 500 до 1000 видов бактерий. Установлено, что общая численность микробных клеток интестинальной микробиоты взрослого человека в среднем составляет 1014 КОЕ/г, что в 10 раз превышает численность клеток самого организма, а по числу совокупных генов превосходит кодирующую способность генома человека и составляет более 3 млн генов. Микробиота кишечника выполняет ряд важнейших функций: защитные, метаболические, трофические (структурные). ВИЧ-инфекция разрушительно влияет на физиологическое взаимодействие между условно-патогенной микрофлорой и иммунной системой. Нарушения иммунологических и эпителиальных барьеров приводят к энтеропатии, синдрому мальабсорбции, бактериальной транслокации и кишечным инфекциям. Длительная бактериальная транслокация в сыворотке крови ВИЧ-инфицированных пациентов может приводить к системному воспалительному ответу, который, в свою очередь, может вести к прогрессированию заболевания и истощению иммунитета. В обзоре представлены современные данные о микробиоме человека, методах его исследования, таксономическом составе и функциях. Отдельно рассмотрен патогенез поражения желудочно-кишечного тракта при ВИЧ-инфекции, обозначены проблемы и перспективы изучения микробиома у ВИЧ-инфицированных больных.
The importance of the intestinal microflora for human health has long been proven in many studies. Gut bacteria not only help digest foods, but are also involved in metabolic regulation as a whole, actively cooperate with the immune system, and support the body in the fight against bacterial and viral infections. From 500 to 1000 species of bacteria live in different parts of the human gastrointestinal tract. The total number of microbial cells in the adult gut microbiota was ascertained to average 1014 CFU/g, which was 10 times higher than that in the organism itself, and, in terms of the number of total genes, it exceeds the coding capacity of the human genome and accounts for more than three million genes. The gut microbiota performs a number of the most important functions: protective, metabolic, and trophic (structural) ones. HIV infection destructively affects the physiological interaction between the opportunistic microflora and the immune system. Impairments in the immunological and epithelial barriers lead to enteropathy, malabsorption syndrome, bacterial translocation, and intestinal infections. Prolonged bacterial translocation in the serum of HIV- infected patients can result in a systemic inflammatory response, which in turn can lead to disease progression and immune depletion. The review presents an update on the human microbiome, its studies, taxonomic composition, and functions. It considers separately the pathogenesis of gastrointestinal tract lesions in HIV infection and outlines the problems and prospects of studying the microbiome in HIV-infected patients.