CRYSTALLINE STRUCTURE AND HIRSHFELD SURFACE ANALYSIS OF 7-((6-HYDROXY-2,5,5,8A-TETRAMETHYL-1,4,4A,5,6,7,8,8A-OCTAHYDRONAPHTHALEN-1-YL)METHOXY)-2H-CHROMEN-2-ONE ISOLATED FROM FERULA PERSICA ROOTS: A NEW ENANTIOMORPH AT 100K

An ethanol extract was obtained from the underground part of Ferula persica Wild., collected during the fruiting phase, which, after the solvent removal, was chromatographed on a column with neutral “Alumina” (II degree of activity) and eluted with hexane, benzene, and their mixtures in a gradient of increasing polarity. As a result, 7-((6-Hydroxy-2,5,5,8a-tetramethyl-1,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl)methoxy)-2H-chromen-2-one (conferol - m.p. 137-138 ºC), was isolated. To confirm the structure, we used X-Ray, NMR 1H, 13C NMR, DEPT, COSY, HSQC, and HMBC methods. It has been previously mentioned about crystalline structure of the given compound C24H30O4, isolated from F. persica roots at room temperature. Unlike literature data in this study crystalline structure was determined with higher precision at 100 K (-173 ºC). The compound being investigated consists of octahydronaphthalene fragment, attached to the chromen-2-one fragment through an oxymethylene bridge. The title compound is a new enantiomorph of the one reported previously. In the crystal the molecules are connected by C-H···O hydrogen bonds along the c-axis forming the layers parallel to the (010) plane, while molecules are linked by O-H···O hydrogen bonds, which generate R22(6) motifs along the a-axis. The C-H···π and van der Waals interactions between these layers stabilize and maintain the structure. The Hirshfeld surface analysis indicates that the most important contribution to the crystal packing are from H···H (58,3%), O···H/H···O (21,8%) and C···H/H···C (19,7%) contacts.

Из подземной части Ferula persica Wild., собранной в фазу плодоношения, получали этанольный экстракт, который после удаления растворителя хроматографировали на колонке с нейтральным «оксидом алюминия» (II степень активности) и элюировали гексаном, бензолом и их смесями с постепенно возрастающей полярностью. В результате был выделен 7-((6-гидрокси-2,5,5,8а-тетраметил-1,4,4а,5,6,7,8,8 а-октагидронафталин-1-ил)метокси)-2Н-хромен-2-он (конферол - т.пл. 137-138 °C). Для подтверждения его структуры использовали методы рентгенографии, ЯМР 1H, ЯМР 13C, DEPT, COSY, HSQC и HMBC. Ранее сообщалось о кристаллической структуре названного соединения C24H30O4, изолированного из корней F.persica при комнатной температуре. В отличие от литературных данных, в этом исследовании кристаллическая структура определена с более высокой точностью при 100 К (-173 ºC). Исследуемое соединение состоит из фрагмента октагидронафталина, присоединенного к фрагменту хромен-2-он через оксиметиленовый мостик. Титульное соединение является новым энантиоморфом соединения, о котором сообщалось ранее. В кристалле молекулы соединены водородными связями C-H···O вдоль оси c, образуя слои, параллельные плоскости (010), в то время как молекулы связаны водородными связями O-H···O, которые генерируют структурные R22(6) вдоль оси a. Взаимодействия C-H···π и ван-дер-Ваальса между этими слоями стабилизируют и поддерживают структуру. Анализ поверхности Хиршфельда показывает, что наиболее важный вклад в упаковку кристаллов вносят контакты H···H (58,3%), O···H/H···O (21,8%) и C···H/H···C (19,7%).

Authors
Karimli E.G.1, 2 , Mamedov İ.G.3 , Khrustalev V.N. 4, 5 , Akkurt M.6 , Khalilov A.N.3, 7 , Mamedov A.M.8 , Kerimov Y.B.1 , Ibadullayeva S.J.2 , Aleskerova A.N.2
Number of issue
4
Language
English
Pages
61-73
Status
Published
Year
2023
Organizations
  • 1 Azerbaijan Medical University
  • 2 Institute of Botany, Ministry of Science and Education of the Republic of Azerbaijan
  • 3 Baku State University
  • 4 Peoples' Friendship University of Russia
  • 5 N. D. Zelinsky Institute of Organic Chemistry RAS
  • 6 Erciyes University
  • 7 Azerbaijan State Economic University
  • 8 Institute of Petrochemical Processes named after Academician Y. G. Mammadaliyev
Keywords
Ferula persica; extraction; chromatography; spectroscopy; crystalline structure; enantiomorph; O-H···O hydrogen bonds; C-H···π interactions; Redetermination; Hirshfeld surface analysis; экстракция; хроматография; спектроскопия; кристаллическая структура; энантиоморф; водородные связи O-H···O; C-H···π взаимодействия; переопределение; анализ поверхности Хиршфельда
Date of creation
01.07.2024
Date of change
01.07.2024
Short link
https://repository.rudn.ru/en/records/article/record/110096/
Share

Other records

ПОКЛОНОВ В.А., ОСТРОУМОВ С.А., АНИКИНА Е.В., САДЧИКОВ А.П., ГЛЕБОВ В.В., ЕРОФЕЕВА В.В.
Вестник Северо-Восточного федерального университета им. М.К. Аммосова. Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова. Vol. 21. 2024. P. 24-32